Rの使い方：tableoneでの2群比較

Rの使い方：2群比較

まず、『tableone』パッケージをインストールしましょう。

パッケージのインストール方法は2つあります。

パッケージをインストールする2つの方法

①ツールを使う

RStudio上部のバーに表示されている『Tools』をクリックし、『Install Packages』を選択します。

Packagesにtableoneを入力し、Installをクリックすれば完了です。

②コードを使う

install.packages(“tableone”)を実行します。

install.packages("tableone")

これでtableoneパッケージを使用することができるようになりました。

2群比較

今回も練習用のデータを使用して、MaleかFemaleかで、BMI, HT, DMに差があるか解析します。

練習用のデータはこちら

統計が不安な方はこちらが参考になると思います。

使用前に先ほどインストールしたパッケージの中にある、tableoneライブラリを読み込んでおきます。

library(tableone)

これでCreateTableoneという機能で群間比較を行うことができます。

varsにあたる比較したいものをbaseline（任意の文字列）に入れ込んでおきます。

baseline <- c("BMI", "HT", "DM")

varsに含まれる名義変数をbaseline_factor（任意の文字列）に入れ込んでおきます。

baseline_factor <- c("HT", "DM")

CreateTableOneを使用します。

Createtableone(vars = 比較したいもの, strata = 比較するグループ, data = データ名, factorVars = varsに含まれる名義変数)

table1 <- CreateTableOne(vars = baseline, 
                        strata = "Male", 
                        data =df,
                        factorVars = baseline_factor)
table1

上記を実行すると、患者背景の表が完成します。

3群比較も同様の方法でできます。

今回のコードをまとめます。

library(tableone)
baseline <- c("BMI", "HT", "DM")
baseline_factor <- c("HT", "DM")
table1 <- CreateTableOne(vars = baseline, 
                        strata = "Male", 
                        data =df,
                        factorVars = baseline_factor)
table1

今回使用した練習用のデータはこちら